| GI |
158934559  |
| Accession |
AM269770 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma adspersum
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGT |
| Structure |
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).))))).... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-50.3 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGT--------------
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((.--((....)).))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....)))---...)))))))).......(((((......)))))....--------------
CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________((___(_(__(______)__)_)___))___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 92.308
III: 96.296
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 410
End: 603
|
