GI |
158934558  |
Accession |
AM269769 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sp. SP16
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGC |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-46.7 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGC--------------- ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))---...)))))))).......(((((......)))))...--------------- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 399
End: 591 |