GI |
158934562  |
Accession |
AM269773 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTANGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-38 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA---------- ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...---------- Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCCTTTGC-GGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTANGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA ........(((((((((((((((.....-)))))))))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(....(((.((.((((.((((...))).).)))).))))).)))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____((__________))____)________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.75 II: 92.308 III: 91.667 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 405
End: 608 |