GI |
165941427  |
Accession |
EU239383 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma australe
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAACTTCTTATGGGGCTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGACTACTATATAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAATCGTCTCGTTAGAGAGACAACCTTTATGACCTCTGACCTCAAAT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-41.6 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCC-CTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA-------- ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(-((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................-------- Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAACTTCTTATGGGGCTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGACTACTATATAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAATCGTCTCGTTAGAGAGACAACCTTTATGACCTCTGACCTCAAAT ....((..((((((((((((.((((....)))).))))))).))))).))(((((...(((((..(.((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).......................... CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(__________________________)________________________(_________)__________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 366
End: 587 |