Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 169260522

Figure

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Details

GI 169260522 see NCBI Nucleotide
Accession EU347829
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Crotalarieae ; Lebeckia ; Lebeckia pungens 
Sequence GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGGATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGTTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
Structure ((((((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
Method 2: Homology modeled
Energy -64.7 kcal/mol
Model 157673676
Alignment 
Sbjct: GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCCGGGCACCGAGCGGGGCGAGTGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG--
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Query: GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGGATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGTTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
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 CBCs: _____________________(____________)_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____(__(_(____________(_________)_______________)_))____________________________________________________(_____________________(_____________________)_____________________)______________________________(______________)______
Transferred percentage of helices I: 100
II: 100
III: 100
IV: 100
Annotation Process: HMM annotation
Start: 497
End: 720

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