GI |
169656019  |
Accession |
EU486458 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma carnosum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-42.4 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA---------- ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...---------- Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA ........((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____((__________))____)________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 95.833 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 381
End: 585 |