GI |
171188489  |
Accession |
EU526004 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. OSC 1064248
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Sequence |
ATTAAATTCTCAACTTCAGAAAGGTTATTGCCTTATTTGAATTGGATGTTGGAGGGCTTGCTGATGTTGTTGTCAGCTCCTCTTAAATGCATTAGCGGAATTTTAAGGACCGGCTTTGGTTTGATAATCCTATCTATGCCATTGCTGTGGATCTTTGTGTGTTCAGCTTCTAATGGTCTTTTGGACTGTCTCATTGGGTGAGGCATATATAGTGTCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-17.4 kcal/mol |
Model |
310751988 |
Alignment |
Sbjct: ATTAAATTCTCAACTCCGAATCGATTTGTTTCGACCTCGGAGCTTGGACTTTGGAGTG--TGCTGGCGT--CTGTCGGCTCCTCTTAAATGCATCAGCGGAA-TGTAACCCCGGACATCAGTGTGATAATTGTGT-TGCGCTGTCGT--CCGAGGTATAAAAGTTC-GCTCATAATGGTC-TTCGGACAAACTTTACAATCAAATTT--------------- .........((((((((((.((((......))))..)))))).))))..((.((((..--.((((((..--..))))))..)))).))....((.((((((.-..(((((.(((((..((((((((((....)))-)))))))..))--))).))).))....)))-))).))....(((-....)))...................--------------- Query: ATTAAATTCTCAACTTCAGAAAGGTTATTGCCTTATTTGAA--TTGGATGTTGGAGGGCTTGCTGATGTTGTTGTCAGCTCCTCTTAAATGCATTAGCGGAATTTTAAGGACCGGCTTTGGTTTGATAATCCTATCTATGCCATTGCTGTGGATCTTTGTGTGTTCAGCTTCTAATGGTCTTTTGGACTGTCTCATTGGGTGAGGCATATATAGTGTCTTGA .........((((.(((((.((((......))))..)))))--))))...(.((((.....((((((......))))))..)))).).....(..((((((....(((((.(((((..((((.(((((....))).)).))))..))..))).))).))....))).)))..)....(((.....))).................................. CBCs: _______________(_(__((_(______)_))___)_)____________________________________________________________________((__(_(___((_____________________))___)___)__))___________________________________________________________________ HCBCs: __________________(_________________)__________________________(_((______))_)____________________________(_______(_________(__(______)___)___________)________)_______________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 91.667 III: 92.857 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured fungus

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 402
End: 621 |