Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 18481519

Figure

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Details

GI 18481519 see NCBI Nucleotide
Accession AF461583
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus 
Sequence ATGAAATCTCAACCATTAGGGTTTCTTAATGGCTTGGATTTGGAGGTTGCCATTCTGAATGGCTCCTCTCAAAAGAGTTAGCGAGTTTAACTATTGCTATCTGGCGTAATAAGTTTCGCTGGAATGGTATTGTGAAGCGCGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATTACTTTGACTCTGG
Structure ...(((((.(((((((((((....)))))))).))))))))(((((..((((((...)))))).)))))....(((...((((.((((.((.(.((((((((((((.((....)).)))))).))))))).)).)))).)))))))....(((....))).................
Method 2: Homology modeled
Energy -52.1 kcal/mol
Model 20378507
Alignment 
Sbjct: ATGAAATCTCAACCATTAGGGTTTCTTAATGGCTTGGATTTGGAGGTTGCCAGTCTGACTGGCTCCTCTTAAAGGAGTTAGCAAGTTTGACTATTGCTATCTGGCGTAATAAGTTTCGCTGGAATGGTATTGTGAAGCGTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATT-TTTTGACTCT--
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Query: ATGAAATCTCAACCATTAGGGTTTCTTAATGGCTTGGATTTGGAGGTTGCCATTCTGAATGGCTCCTCTCAAAAGAGTTAGCGAGTTTAACTATTGCTATCTGGCGTAATAAGTTTCGCTGGAATGGTATTGTGAAGCGCGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATTACTTTGACTCTGG
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 CBCs: ____________________________________________________(_____)_______________________(________________________________________________________)_____________________________________
HCBCs: _________________________________________________________________________(_______________________________________________________________________)_______________________________
Transferred percentage of helices I: 100
II: 100
III: 100
IV: 100
Annotation Process: HMM annotation
Start: 318
End: 494

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