GI |
17426631  |
Accession |
AJ301927 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; mitosporic Glomerellaceae ; Colletotrichum ; Colletotrichum lupini
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Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-40.5 kcal/mol |
Model |
148807690 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCA-AGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.....-.))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATCCGGA-GGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((.(((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..))))))))))-))....))))))....)))...(((((.......))))). CBCs: ____________________________________(___________)_____________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 96.667 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 982
End: 1145 |