GI |
17426638  |
Accession |
AJ301934 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; mitosporic Glomerellaceae ; Colletotrichum ; Colletotrichum lupini
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Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTASCAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-47.2 kcal/mol |
Model |
148807690 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCA--AGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.....--.))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTASCAGGTTGA ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((........))))). CBCs: ____________________________________(___________)______________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 982
End: 1147 |