GI |
174564  |
Accession |
L07844 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Acoelomata ; Platyhelminthes ; Trematoda ; Digenea ; Echinostomida ; Echinostomata ; Echinostomatoidea ; Fasciolidae ; Fasciola ; Fasciola hepatica
|
Sequence |
CTTATATACTATCACGACGCCCAAAAAGTCGTGGCTTGGGTTTTGCCAGCTGCGTGATCTCCTCTATGAGTAATCAGTGAGGTGCCAGATCTATGGCGTTTCCCTAATGTATCCGGATGCACCCTTGTCTTGGCAGAAAGCCGTGGTGAGGTGCAGTGGCGGAATCGTGGTTTAATAATCGGGTTGGTACTCAGTTGTCAGTGTGTTTGGCGATCCCCTAGTCGGCACACTTATGATTTCTGGGATAATTCCATACCAGGCACGTTCCGTCACTGTCACTTTGTCATTGGTTTGATGCTGAACTTGGTCATGTGTCTGATGCTATTTTCATATAGCGACGGTACTCATATCCGCTGGCCTGTCTTC |
Structure |
...........(((((((.........)))))))...(((...((((((((((...(...(((((.(((....)))).))))))).)).)...)))))...)))....(((((.(((((((.((..((.((((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((.........((.(((((((((((((..((((((((((.((((..(.....)))))))))))...))))..))))).))...))).))).))))))))))))))))).)))))))))).))))))..))))))))..))...))))))))))))..............(((((..((.((....).))).)))))... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-99.9 kcal/mol |
Model |
291062453 |
Alignment |
Sbjct: ---ATAAACTATCACGACGCCCAAAAAGTCGTGGCTTGGGTTTTGCCAGCTGGCGTGATCTCCTCTATGAGTAATCATGTGAGGTGCCAGATCTATGGCGTTTCCCTAATGTATCCGGATGCACCCTTGTCTTGGCAGAAAGCCGTGGTGAGGTGCAGTGGCGGAATCGTGGTTTAATAATCGGGTTGGTACTCAGTTGTCAGTGTGTTCGGCGATCCCCTAGTCGGCACACTCATGATTTCTGGGATAATTCCATACCAGGCACGTTCCGTTACTGTTACTTTGTCATTGGTTTGATGCTGAACTTGGTCATGTGTCTGATGCTA-TTTCATATAACGACGGTACCC---TTCG-TGGTCTGTCTTCC ---........(((((((.........)))))))...(((...(((((.(((((.......(((((((((....))))).)))).))))).....)))))...)))....(((((.(((((((.((..((.((((((..((((((.((((((((((((((((((((.((((.........((.((((((..(((((..((((((((((.((((.........))))))))))...))))..)))))......))).))).))))))))))))))))).)))))))))..))))))..))))))))..))...))))))))))))..-...........(((((.(((.---....-.)))))))).... Query: CTTATATACTATCACGACGCCCAAAAAGTCGTGGCTTGGGTTTTGCCAGCT-GCGTGATCTCCTCTATGAGTAATCA-GTGAGGTGCCAGATCTATGGCGTTTCCCTAATGTATCCGGATGCACCCTTGTCTTGGCAGAAAGCCGTGGTGAGGTGCAGTGGCGGAATCGTGGTTTAATAATCGGGTTGGTACTCAGTTGTCAGTGTGTTTGGCGATCCCCTAGTCGGCACACTTATGATTTCTGGGATAATTCCATACCAGGCACGTTCCGTCACTGTCACTTTGTCATTGGTTTGATGCTGAACTTGGTCATGTGTCTGATGCTATTTTCATATAGCGACGGTACTCATATCCGCTGGCCTGTCTTC- ...........(((((((.........)))))))...(((...(((((.((-((.......(((((.(((....)))-).)))).)).)).....)))))...)))....(((((.(((((((.((..((.((((((..((((((.((((((((((((((((((((.((((.........((.((((((..(((((..((((((((((.((((.........))))))))))...))))..)))))......))).))).))))))))))))))))).)))))))))..))))))..))))))))..))...))))))))))))..............(((((..((..........)).)))))...- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(____(_________________________________________________(_______________)______________________________________________)_____)___________________________________________________________________(__________)___________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 90.909 III: 100 IV: 87.5 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 1
End: 366 |