GI |
1754541  |
Accession |
AB000003 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris ; Rhizoctonia solani
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Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTGAAATCTTTTGTTAATTCAATCGGTTCTACTTTGGTATTTGGAGGTCTTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATACAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAAATCCATTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-13.3 kcal/mol |
Model |
117938168 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCTACTTTGGTA-TTGGAGGTC-TTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAACAC-GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGAC-ACTATTTTTATGATCTGA .........(((((((-(.(((..(((......)))..)))..))))))))..-..(((((..-...((((........)))).)))))..(((((((.((....((((.((((((((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))..))))))))-........))))...)).)))))))...........(((((......)))))-.................. Query: ATGAAATCTTCAAAGTGAAATCTTTTGTTAATTCAATCGGTTCTACTTTGGTATTTGGAGGTCTTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATACAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAAATCCATTTATGATCTGA .........(((((((.(.(((..(((......)))..)))..)))))))).....(((((......((((........)))).)))))..((.((((.(.....(.((..(.(((((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))..))))).)..........)).)....).)))).))...........(((((......)))))................... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 85.714 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 361
End: 602 |