GI |
1754548  |
Accession |
AB000010 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris ; Rhizoctonia solani
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Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTAAACCTTTTGTTAATTCAATTGGTCTTTTTTACTTGTTTTGGAGGATCTTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCGTAAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAATATTCTATTTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-2.1 kcal/mol |
Model |
83272313 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCCTCAAAATAAATCTTTTGTTAATTCAACTGGTTTACTTTG---GACTTGGAGG---TCTTTGCAGATTTCACGTCTGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCTGTATG---AACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAG-TATCACTCGCTGAGGACAC---TGTAAAAGG-GGCCGGGATTATT----ATGAACCGCTTCTTAATAGTCCATTGACTTGGACAAACTAC----TTATGATAT-- .........(((((.((((((....(((.....))).)))))).))))---)....(((((---.....((((((.....)))))).)))))..........(((.((.((...(((---(.(((((((((.(((((((.(((...-.)))...))))))).....---.......))-))))))).)))).----..)).)))))........(((((......))))).......----.........-- Query: ATGAAATCTTCAAAGTAAACCTTTTGTTAATTCAATTGGTCTTTTTTACTTGTTTTGGAGGATCTTATTGCAG-CTTCACACCTGCTCCTCTT-TGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCGTAAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTC-TAATAGTCCATTGACTTGGACAATATTCTATTTTATGATCTGA .........(.(((..(.(((....(((.....))).))).)..)))....)....(((((........((((-........)))).))))).-........(((.((.((....(......(((((((((.(((((((.(((.....)))...)))))))...............)).)))))))...)........)).)))))..-.....(((((......)))))...................... CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________________)____________________________________________________________________ HCBCs: ___________________(_____(_________)__)____________________________________________________________________________________(____________________________________________________________)___________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 78.571 II: 81.818 III: 90 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 368
End: 616 |