GI |
18366  |
Accession |
X17534 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; asterids ; campanulids ; Apiales ; Apiineae ; Apiaceae ; Apioideae ; Scandiceae ; Daucinae ; Daucus ; Daucus carota
|
Sequence |
ACGCATCGTGTTGCCCCTGACCAAACATCTCCTCGAGAGATTTATTTGTTCAGGGGCGGAAATTGGCCTCCCGTGCCTTTTGTGTGCGGTTGGCTCAAAAATGAGTCTCTGGTGACGGGCATCACGACATCGGTGGTTGTAAGAAGACCTTCTTGTGTCGTTGTGTATACCCGCCGCAGTAGGGAACTCGAGGGCCCTTGGGCACAGCAAAAATTGTGTGCACTTCGATTGT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-62.5 kcal/mol |
Model |
109631888 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTGTTGCCCCTGACCAAACATCTCCTCCGGAGATTTATTTGTTTAGGGGCGGAAACTGGCCTCCCGTGCCTTTTGTGTGCGGTTGGCTCAAAAATGAGTCTCTGGTGACGGGCATCACGACATCGGTGGTTGTAAGAAGACCTTCTTGTGTTGTTGTGTATGCCCGCCACAGTAGGGAACTCGAGGGCCCTTGGGCACTACAAGAATTGTGTGCACTTCGA---- .......((.((((((((((.((((.((((((...))))))...)))).))))))))))..)).((((..((((((.......))))))..))))..........(((((((((.((((((((((((((.(((.((((.......))))...)))...))))))).))))))).)))..))))))..((((((........((((.((((...)))))))).))))))---- Query: ACGCATCGTGTTGCCCCTGACCAAACATCTCCTCGAGAGATTTATTTGTTCAGGGGCGGAAATTGGCCTCCCGTGCCTTTTGTGTGCGGTTGGCTCAAAAATGAGTCTCTGGTGACGGGCATCACGACATCGGTGGTTGTAAGAAGACCTTCTTGTGTCGTTGTGTATACCCGCCGCAGTAGGGAACTCGAGGGCCCTTGGGCACAGCAAAAATTGTGTGCACTTCGATTGT .......((.((((((((((.((((.(((((.....)))))...)))).))))))))))..)).((((..((((((.......))))))..))))..........(((((((((.((((.((((((((..(((.((((.......))))...)))....)))))).)).)))).)))..))))))..((((((........((((.((((...)))))))).)))))).... CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______(__________(_______________________________)___________)_________________________________________________(______________________________________________________________)______________________________(_________)_______________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.455 II: 100 III: 93.333 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 603
End: 834 |