| GI |
18481501  |
| Accession |
AF461565 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
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| Sequence |
GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGTTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTGCTAATCGCAATCTATTCCATTTTCAATTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-22.9 kcal/mol |
| Model |
189016630 |
| Alignment |
Sbjct: ATTAAATTCTCAACCTAACCAGTTTTT--------ACGAGCTTGGATAGGCTTGGATG-TGGGAGTTGCGGGCTTCTCAGAAG--TCGGCTCTCCTTAAATGCATTAGTGAATTCTT-------TGTTGACCATCCTTGGTGTGATAATTATCTA--CGCCATTGAC-----------TGATCAGCTCTTATGGGATTCGCT-TCTAACCAGTCCTTAGGACAACCCCTGACATTTTGA-----------------
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Query: GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTAAATAAAAAGGTTGTCTTAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCGTTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGTTGACCCTTGTGATGACATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGCTTATGGGTTGCTAATCGCAATCTATTCCATTTTCAATTTTGA
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HCBCs: ___________________((___(____________)____))__________________________________________________________________(__(_________________(________(_(___________)___)____________________)______________)__)_____________(__(___)__)__________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 80
II: 76.923
III: 75
IV: 75
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| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetes incertae sedis
Cantharellales
Clavulinaceae
Clavulina
Clavulina sp. ECM13
| Clavulina sp. EMF16
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| environmental samples
uncultured Clavulina
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 408
End: 663
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