GI |
18481504  |
Accession |
AF461568 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTCGCCGTGAAGAGCTTGGATCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATGAATCAGCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGCTGGAGCTTACAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACACCTTTTGAGCGTTCGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-55.6 kcal/mol |
Model |
118420565 |
Alignment |
Sbjct: ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTTTCCGTGATGAGCTTGGACTCTGGGGGTTTTGTTGGCCTGTGGTCAGCTCCCCTCAAACGAAGTAGCTTGCCGGTTTTTGGTGGCATCATGGGTGTGATAACTATCTACGCTCGTGGCTGTTTACCAGGTAACCTCT--------GGGTTTGCTGGAGCTTATAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACAGCTTTTTGAACGTTCGA .........(((((((((((((....)))))).))).)))).....(((((....(((((((...))))))).))))).........((((..(((((((.((((((((((((((((((((((....))).)))))))))).)).)))))))..))))...--------.)))..))))((((((..(((.((.(((((.....)))))..)).)))..)).)))).. Query: ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTCGCCGTGAAGAGCTTGGA-TCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATGAATCAGCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGCTGGAGCTTACAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACA-CCTTTTGAGCGTTCGA .........(((((((((((((....)))))).))).)))).-...(((((.....(((.(.....).)))..))))).........((((..(((.((..(((((((((.(.((((((((((....))).))))))).)..)).)))))))...)).............)))..))))((((((..(((.(..(((((.....)))))..-).)))..)).)))).. CBCs: _________________________________________________________(___________)_______________________________________(________________________________)_____________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________(_____________((__(_(_____(_______________________)_______)_)__))__________________________)____(____________________________________)_______ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 75 III: 87.879 IV: 93.75 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 404
End: 629 |