| GI |
18481505  |
| Accession |
AF461569 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
| Sequence |
ACGAACACCTCAANTCTCACGGTTCGCCGTNAAGAGCTTGGATCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATNAATCAGCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGTTGGAGCNTACAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACACCTTTTGAACGTTCGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-38.3 kcal/mol |
| Model |
118420565 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTTTCCGTGATGAGCTTGGACTCTGGGGGTTTTGTTGGCCTGTGGTCAGCTCCCCTCAAACGAAGTAGCTTGCCGGTTTTTGGTGGCATCATGGGTGTGATAACTATCTACGCTCGTGGCTGTTTACCAGGTAACCTCT--------GGGTTTGCTGGAGCTTATAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACAGCTTTTTGAACGTTCGA
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Query: ACGAACACCTCAANTCTCACGGTTCGCCGTNAAGAGCTTGGA-TCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATNAATCAGCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGTTGGAGCNTACAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACA-CCTTTTGAACGTTCGA
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CBCs: _________________________________________________________(___________)_______________________________________(________________________________)_____________________________________________________________________________________
HCBCs: _______________________________________________________________________________________(_(___________((__(_(_____(_______________________)_______)_)__))________________________)_)_________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 84.615
II: 75
III: 87.879
IV: 87.5
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 395
End: 620
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