GI |
18481506  |
Accession |
AF461570 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATGAACACCTCAACTCTCATGGCTTGCCATGATGAGCTTGGACTTTGGAGGCTTTACTGGCCCGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTACCGGTGCACGGTGGCGTTGCAGGTGTGATAACTATCTACGCTTGCGATCGTCCGCCAGGTAACCTCTGGCATCGTTGGAGGTTCGCTGGGGCTTACAAATGTCTCTCCTCAGCGAAGACNGATTTCTGAACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-52.71 kcal/mol |
Model |
162311583 |
Alignment |
Sbjct: ATGAACACCTCAACTCTCATGGTTTTGCCGTGATGAGCTTGGACTTTGGAGGTCTTGCCGGCCTGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTGCCAGTGTTTGGTGGCGTCACAGGTGTGATAACTATCTACGCTTATGG-CTTCCACCGGGTAACCNTCAGCA---ATNGANGTTCGCTGGAGCTCATAAATGTCTCTCCTCAGTGAGGACGGCTTCTTGAATGTTTGA .........((((((((((((((...))))))).))).))))..((((((((....(((((((...))))))).)))).)))).......(((......((((((((((.((((.(((((((((....))).)))))).)))-)..))))))))))......))).---...((.(((((..((((((.......(((.(((......)))))))))))).)))))..)).. Query: ATGAACACCTCAACTCTCATGG-CTTGCCATGATGAGCTTGGACTTTGGAGGCTTTACTGGCCCGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTACCGGTGCACGGTGGCGTTGCAGGTGTGATAACTATCTACGCTTGCGATCGTCCGCCAGGTAACCTCTGGCATCGTTGGAGGTTCGCTGGGGCTTACAAATGTCTCTCCTCAGCGAAGACNGATTTCTGAACGTTTGA .........(((((((((((((-....)))))).))).))))..((((((((.....((((((...))))))..)))).)))).......(((......(((..(((((.((((.(((((((((....))).)))))).))).)..)))))..)))......))).......((.(((((..(((.(........(((..((......)).))).).))).)))))..)).. CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________(_________________________)____________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________(_________)____________________________(___________)_____________________(________(____(____((___________________________))______)____)________)____________(______(_(________________________________)_)_____)______ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 93.333 III: 92.308 IV: 84.211 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 397
End: 627 |