GI |
18481507  |
Accession |
AF461571 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATGAACACCTCAACTCTCATGGCTTGCCATGATGAGCTCGGACTTTGGAGGCTTTGCTGGCCTGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTACCGGTGCACGGTGGCGTTGCAGGTGTGATAACTATCTACGCTTGCGATCGTCCGCCAGGTAACCTCTGGCATCGTTGGAGGTTCGCTGGGGCTTACAAATGTCTCTCCTCAGCGAAGACGGATTTCTGAACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-57.21 kcal/mol |
Model |
162311583 |
Alignment |
Sbjct: ATGAACACCTCAACTCTCATGGTTTTGCCGTGATGAGCTTGGACTTTGGAGGTCTTGCCGGCCTGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTGCCAGTGTTTGGTGGCGTCACAGGTGTGATAACTATCTACGCTTATGG-CTTCCACCGGGTAACCNTCAGCA---ATNGANGTTCGCTGGAGCTCATAAATGTCTCTCCTCAGTGAGGACGGCTTCTTGAATGTTTGA .........((((((((((((((...))))))).))).))))..((((((((....(((((((...))))))).)))).)))).......(((......((((((((((.((((.(((((((((....))).)))))).)))-)..))))))))))......))).---...((.(((((..((((((.......(((.(((......)))))))))))).)))))..)).. Query: ATGAACACCTCAACTCTCATGG-CTTGCCATGATGAGCTCGGACTTTGGAGGCTTTGCTGGCCTGTGGTCGGCTCCTCTCAAATGAATCAGCTTACCGGTGCACGGTGGCGTTGCAGGTGTGATAACTATCTACGCTTGCGATCGTCCGCCAGGTAACCTCTGGCATCGTTGGAGGTTCGCTGGGGCTTACAAATGTCTCTCCTCAGCGAAGACGGATTTCTGAACGTTTGA .........((.((((((((((-....)))))).))).).))..((((((((....(((((((...))))))).)))).)))).......(((......(((..(((((.((((.(((((((((....))).)))))).))).)..)))))..)))......))).......((.(((((..(((.((.......(((..((......)).))))).))).)))))..)).. CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________(_________________________)____________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________(_________)____________________________(___________)_____________________(________(____(____((___________________________))______)____)________)____________(______(_(________________________________)_)_____)______ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 100 III: 92.308 IV: 89.474 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 396
End: 626 |