GI |
18481510  |
Accession |
AF461574 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTCGCCGTGAAGAGCTTAGATCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATGAATCANCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGCTGGAGCTTACAAACGTCTCTNCTTGGTGGAGACACCTTTTGAACGTTCGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-37.2 kcal/mol |
Model |
118420565 |
Alignment |
Sbjct: ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTTTCCGTGATGAGCTTGGACTCTGGGGGTTTTGTTGGCCTGTGGTCAGCTCCCCTCAAACGAAGTAGCTTGCCGGTTTTTGGTGGCATCATGGGTGTGATAACTATCTACGCTCGTGGCTGTTTACCAGGTAACCTCT--------GGGTTTGCTGGAGCTTATAAACGTCTCTCCTTGGTGGAGACAGCTTTTTGAACGTTCGA .........(((((((((((((....)))))).))).)))).....(((((....(((((((...))))))).))))).........((((..(((((((.((((((((((((((((((((((....))).)))))))))).)).)))))))..))))...--------.)))..))))((((((..(((.((.(((((.....)))))..)).)))..)).)))).. Query: ATGAACACCTCAACTCTCACGGTTCGCCGTGAAGAGCTTAGA-TCTGGGGGTTTGCTGGCCATGCGGCCTGCTCCCCTCAAATGAATCANCTTGCCAGTGTCTGGTGGCGTCATGGGTGTGATAACCATCTACGCTCACGTCCGTCTGCCGGGTAACCTTCATCACTGGAGGTTCGCTGGAGCTTACAAACGTCTCTNCTTGGTGGAGACA-CCTTTTGAACGTTCGA .........(.(((((((((((....)))))).))).)).).-...(((((.....(((.(.....).)))..))))).........((.(..(((.((..(((((((((.(.((((((((((....))).))))))).)..)).)))))))...)).............)))..).))((((((..(((.(..(((.(.....).)))..-).)))..)).)))).. CBCs: _________________________________________________________(___________)_______________________________________(________________________________)_____________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________(_____________((__(_(_____(_______________________)_______)_)__))__________________________)_________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.308 II: 75 III: 84.848 IV: 87.5 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 402
End: 627 |