| GI |
18481515  |
| Accession |
AF461579 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
| Sequence |
ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGGTCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCACGCTCTAAGGGGGAGGGACAGGCCCGAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGAGCGGTCCACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGAAGTCTCTCTTCTACCGCCCCGGTGGGTTGTGCCTAGTGGCTTTGCCGGAGAGTGTCGGTTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTTGA |
| Structure |
.............((((((...))))))((..(((((((..((((((((((.(..(...)).)))))))))))))))))..).)..((((((.((..((.((((.(((((((((((((.(......((((....))))).).))))).))).)).))))))...)..)))..))))))...........((....))............................ |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-30.9 kcal/mol |
| Model |
225194593 |
| Alignment |
Sbjct: ATTGCCATCCCCTCAAGCTCT--GCTTGGCTTGTTGGGCCAGCGTCCGCCCGTGGCTCCTGTCGCGGGGGGGCGGGCCCGAAAGGCAGTGGCGGCTCCTGGAGACTTGGTCCTTTGGGCGGTGATGC-----ATGGGTCTCT-TCATCCACCGTCCC-GTTGGCCACGCCCCGGGAGTCTGTCAACGATTGGTCTTCCCCCTTTAGGTTGA------------------------
.............(((((...--)))))((((.(((((((...((((.((((((((....)))))))).)))).))))))).))))..(((((((((((((.....(((.((..((((((((((((.-----..((....))-.))).))))).)))-)..)))))....))))))).))))))...............((....))....------------------------
Query: ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGG-TCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCACGCT-CTAAGGGGGAGGGACAGGCCCGAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGAG---CGGTCC-ACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGAAGTCTCTCTTCTACCGCCCCGGTGGGTTGTGCCTAGTGGCTTTGCCGGAGAGTG----TCGGTTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTTGA
.............(((((.....)))))(-(..(((((((...((((.((((.(...-....).)))).)))).)))))))..).)..((((((.((...(..---(((.((-.((((((((((.(........((....))..).).))))).))).)..)))))....)...))..)))))).......----....((....))............................
CBCs: ________________________________________________(__(_(________)_)__)______________________________________(__________________________________________________________)_____________________________________________________________________
HCBCs: ______________(___________)_(_________(_____(__________________________)___)_________)__(_((((_(____(______((_____(_______((______________________)_)_________)____))_____)____)__))))_)_______________((____))____________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 78.261
III: 84.375
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 234
End: 458
|
