GI |
18481517  |
Accession |
AF461581 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGGTCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCATGCTCTAAGGGGGAGGGACAGGCCCGAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGAGCGGTCCACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGAAGTCTCTCTTCTACCGCCCCCGTGGGTTGTGCCTAGTGGCTTTGCCCCGAGAGTGTCCATTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-30.1 kcal/mol |
Model |
225194593 |
Alignment |
Sbjct: ATTGCCATCCCCTCAAGCTCT--GCTTGGCTTGTTGGGCCAGCGTCCGCCCGTGGCTCCTGTCGCGGGGGGGCGGGCCCGAAAGGCAGTGGCGGCTCCTGGAGACTTGGTCCTTTGGGCGGTGATGC-----ATGGGTCTCT-TCATCCACCG-TCCCGTTGGCCACGCCCCGGGAGTCTGTCAACGATTGGTCTTCCCCCTTTAGGTTGA------------------------ .............(((((...--)))))((((.(((((((...((((.((((((((....)))))))).)))).))))))).))))..(((((((((((((.....(((.((..((((((((((((.-----..((....))-.))).)))))-.))))..)))))....))))))).))))))...............((....))....------------------------ Query: ATCACTATCCCCTCGAGCCTTTGGCTTGG-TCGTTGGGTCATTGTCCCTCCCATGCT-CTAAGGGGGAGGGACAGGCCCGAAAGGTAGTGGTAGCTCTGGGAG---CGGTCC-ACGGGCGGTGGTGCAGACGAGGGAAGTCTCTCTTCTACCGCCCCCGTGGGTTGTGCCTAGTGGCTTTGCC-CCGA--GAGTGTCCATTTCGGGGAGGAGTCCGCTCCCCCCCTTCAGGTTGA .............(((((.....)))))(-(..(((((((...((((.((((.(...-....).)))).)))).)))))))..).)...(((((.((...(..---(((.((-.((((((((((.(........((....))..).).)))))..))))..)))))....)...))..)))))-....--.........((....))............................ CBCs: ________________________________________________(__(_(________)_)__)______________________________________(__________________________________________________________)_____________________________________________________________________ HCBCs: ______________(___________)_(_________(_____(__________________________)___)_________)____((((_(____(______((_____(_______((______________________)_)_________)____))_____)____)__))))_________________((____))____________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 78.261 III: 81.25 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 420
End: 645 |