GI |
189162226  |
Accession |
EU520235 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
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Sequence |
ATGAAATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-26.91 kcal/mol |
Model |
291359275 |
Alignment |
Sbjct: ATGGAATTCTCAACTTATAAATCCTTGTGATCTATAAGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTG-CGGTCGGCTCCTCTTGAATGGATTAACTCGATTCCGTACGGATCGGCTCTCAATGGGATAATTGGCTACCCTGGGACCGTGAAGTGGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCATTAAGACAACTTTTTAACATCTGA .(((.....))).((((((.(((.....))).))))))..((((((((((((((((((((.(((((-((((((((((((.((((...((.....(((((((.....))))))).)))))).))))......))).......))))))))...)).)))))))))))))))..))))).(((((.....)))))........ Query: ATGAAATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCGCGACCGTGAAGC-GTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTATGACCTCTGA .(((.....))).((((((.(((.....))).))))))...(((((((((((((((((((.(.(((.(((((((.((.(.((.(....(.....(((((((.....))))))).).).)).).))...-...)).......))))))))...-).)))))))))))))))..))))..((.((.....)).))........ CBCs: ______________(__(___(_______)___)__)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___(_____)__________(_(_____)_)__________(______________((_______(______________((_____________(_(___________)_)______))__________________________)__________))________________)__(_____________)________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 88 IV: 80 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Polyporales

Ganodermataceae

Ganoderma

Ganoderma lucidum

| Ganoderma applanatum

| Ganoderma tsugae

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 376
End: 574 |