GI |
19153  |
Accession |
X52265 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; asterids ; lamiids ; Solanales ; Solanaceae ; Solanoideae ; Solaneae ; Solanum ; Lycopersicon ; Solanum lycopersicum
|
Sequence |
ACGATCGCGTCGCCCCTCGCACGCCGCAAGGCTTTAGCGCGGGGGCGGAAGCTGGCCTCCCGTGCGCCCCGAGCGCGCGGCCGGCCTAAATGCGAGTCCACGTCGACGGACGTCGCGGCAAGTGGTGGTTGAAACTCAACTCTCTCTTGTTGTCGCGGCTACAGCCCGTCGCGCGTCCGGACTCCCCGACCCTCACCGCGCCTCACCAGGCGCTCCGACCGCGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-89.9 kcal/mol |
Model |
291002696 |
Alignment |
Sbjct: ---ATCGCGTCGCCCCTCCGCACGCCGCGAGGCGTC-GCGCGGGGGCGGAAGCTGGCCTCCCGTGCGCCCCGAGCGCGCGGCTGGCCTAAATGCGAGTCCACGTCGACGGACGTCGCGGCAAGTGGTGGTTGAAACTCAACTCTCTC-CGTTGTCGCGGCTACAGCCCGTCGCGCGTCGGCACTCCCGGACCCTGTTCGCGCCT---TGGGCGCTCCGACC---- ---...((.((((((((.((((((((....))))).-))).))))))))..)).((((..((((((((.....))))))))..)))).......((((((((((((((((..((((((((((.(((.((((((...))))))....)-))))))))))))......)))))).)))).)).)))).((((........(((((.---..)))))))))...---- Query: ACGATCGCGTCGCCCCT-CGCACGCCGCAAGGCTTTAGCGCGGGGGCGGAAGCTGGCCTCCCGTGCGCCCCGAGCGCGCGGCCGGCCTAAATGCGAGTCCACGTCGACGGACGTCGCGGCAAGTGGTGGTTGAAACTCAACTCTCTCTTGTTGTCGCGGCTACAGCCCGTCGCGCGTCCGGACTCCCCGACCCTCACCGCGCCTCACCAGGCGCTCCGACCGCGA ......((.((((((((-((((.(((....))).)..))).))))))))..)).((((..((((((((.....))))))))..)))).......(((((.((((((((((..((((((((((.(((.((((((...))))))....).))))))))))))......)))))).))))..).)))).(.((........(((((......))))))).)....... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________(_______________________)____________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.444 II: 100 III: 97.143 IV: 88.889 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 606
End: 829 |