| GI |
219812914  |
| Accession |
FJ553128 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; environmental samples ; uncultured Agaricomycotina
|
| Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGACAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA |
| Structure |
.........(((((((((.((((......)))).)))).).)))).....(((((..(((.(((.(.(((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))))).).))).)))))))))))..(((((.(..((((((....))...)))))....)))))........ |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-63.3 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGG---CGTCTTCCTTATTGACTTTTGA
.........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(-((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....))---)))).....)))))........
Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGACAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGA---TTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(.(((((---....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))...))).)))))))))))..(((((....((((((....))...)))).....)))))........
CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________)___________________________________________________________________
HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))_____________________________________________(_______(_________________)____)__________________________________(______(_____________)_______)____________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 94.444
III: 94.118
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 620
End: 866
|
