| GI |
193735034  |
| Accession |
EU569245 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. MHM179
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| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGATTTTTCTGTCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGGTCTGATCGTTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCGGTCTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTTGCAGATTGTTTCAATCTGTATTCCACTTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-2.6 kcal/mol |
| Model |
116248608 |
| Alignment |
Sbjct: -ATTAAATTCTCAACTCT---ATCAGCTTGCTGGT--AAAGCTTGGATTGTGGAGGTTGCAG-GCTTCTAACGAGGTCAGCTCCTCTGAAATGTATTAGC-GGTACCCGTGCGGAACCG--TCTA-TTAGTGTGATAATTATCTA--CGCTGTGGACATCTGCTTTAAATGG----------GTTATGCTGCTTCTAA---TGGTCCTTATGGACAATTATAATGACAAT-------------------
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Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGATTTTTCTGTCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGGTCTGATCGTTGAGGACATCT-TTCGGGATGGCCGGTCTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTTGCAGATTGTTTCAATCTGTATTCCACTTTTTCAGCTTTGA
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CBCs: _______________________(((____)))____________________(((________(_(______)_)______)))_________________________________________________________________________________________________________________________(____)_____________________________________
HCBCs: _________________________________________________________________(________)_______________________(_______((__(__________________((_(__(____)___)___))____________)_______))________________)____________(_(_(______)_)_)________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 75
II: 84.615
III: 80
IV: 87.5
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 386
End: 633
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