GI |
194304162  |
Accession |
EU837230 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon bacillisporus
|
Sequence |
AGTTAATTCATCAACCCCTCTCGATTAGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATAGTGGGGGTTGCCGGAGACTTGGGACTAGTTCCAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGAAAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTGTGCTGAAGTGCATGAATGATGGTTCCGTGCCTCTAATACGCATCGACCTTTTACTAGGTCTTTGAAATTTTGACATTTTGA |
Structure |
..........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.(((((((....))))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((.((..(.(((((.....(((....((((((((....)))).))).))))...))))).)..))).)))))))))))..(((.(.(..(((((((......)))))...))..)))))......... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-60.4 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTC-TCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAAT--GTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTC--CTTATTGAC-TTTTGA .........-((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).((((--(....((((((....))))))...--..)))))..-...... Query: AGTTAATTCATCAACCCCTCTCGATTAGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATAGTGGGGGTTGCCGGAGACTTGGGACTAGT-TCCAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGAAAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTGTGCTGAAGTGCATGAATG-ATGGTTCCGTGCCTCTAATACGCATCGACCTTTTACTAGGTCTTTGAAATTTTGACATTTTGA ..........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.((((((......-)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((.((..(.(((((.....(((.....(((((((....)))).)))..)))...))))).)..))-).)))))))))))..(((...(....(((((......))))).......).)))......... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________((______))________________________ HCBCs: __________________(________________)______________________________((_(_(_______)_)_))___________________________________(______________((_____________(_________________)________))_______________)______________________(__________)_______________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 88.235 IV: 81.818 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 431
End: 680 |