| GI |
194304167  |
| Accession |
EU837235 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon semireticulatus
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| Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTAGCTTCTAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGAGACTCGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCTTCTGAAATGCATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGCTCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACCGAAGGTTCCGTGCCTCTAATACGTCGACCACGTATTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTTATTGACTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-57.6 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGAT---------GCCTTCTGGC---------GTCTTCCTTATTGACTTTTGA
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Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTAGCTTCTAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGAGACTCGGA---TTCGTCCAGGACTCGGGCTCTTCTGAAATGCATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGCTCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACCGAA-GGTTCCGTGCCTCTAATACGTCGACCACGTATTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTTATTGACTTTGA-
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HCBCs: _________________________________________________________________((_(___________)_))___________________________________(______(________(_____(_______(_________________)____)___)________)_______)_____________(______(___________(____)___________)_______)____________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 91.667
II: 88.889
III: 94.118
IV: 100
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 322
End: 580
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