| GI |
19550  |
| Accession |
Z15097 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; asterids ; lamiids ; Lamiales ; Phrymaceae ; Mimulus ; Mimulus glaucescens
|
| Sequence |
GGGTTAATATCACCAATCATTATACTTATGTATAATCACTGGTGGATCTGGCTGTTCCAGCTCTGCCGCAGCCTAGCTGCCTAGTGTGCATCTGGATCTGCTGAAGTATAGAGGCTAACCAAGGACCCGTCAAGGGCCGCAACTGGGTGGGCAGAAATGCTATATTCTTAGTTGTTGGCTTGGGACTTTGCTTGTTCGGCCCTCAAACAGGAACCATTAACCTATTTTCTCGA |
| Structure |
.........((((((((.((.(((....))))).))...))))))....(((.(.(((((.((....).....................).))))))..)))........(((((((((((...((((.....((((((((((((((((((((....)))).))..)))))))).)))))))))..)).)...))).)).))))....(((((..(.((...))))))))... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-17.79 kcal/mol |
| Model |
262474822 |
| Alignment |
Sbjct: ----AATTCTCGCCCATCATCTTCCCTGTGTTGATGATC-TGGGCGGATCTGGCTTTCTCAGCTCTCACG---------------------AGCTGGGTTTGCTGAAGTACAGAGGTTAATGCATGGACCCGTTAAGGGCTGCAGCTGGTTAGGCAGTGATGCTAT-CGATTAGCTGTTGGTCTGGGAACT---GCGTTTGACCCTCCACAAGGAA--ACTTAATTATTTCCTCGA
----.....((((((((((((...........)))))..-)))))))....(((...((((((((....)---------------------)))))))...)))........((((..((((((....(((.....(((((((((((((((.((((....))))..-.))))))))).)))))))))...)---)))))....))))....(((((--(........))))))...
Query: GGGTTAATATCACCAATCATTATACTTATGT--ATAATCACTGGTGGATCTGGCTGTTCCAGCTCTGCCGCAGCCTAGCTGCCTAGTGTGCATCTGGATCTGCTGAAGTATAGAGGCTAAC-CAAGGACCCGTCAAGGGCCGCAACTGGGTGGGCAGAAATGCTATATTCTTAGTTGTTGGCTTGGGACTTTGCTTGTTCGGCCCTCAAACAGGAACCATTAACCTATTTTCTCGA
.........((((((.(.((...........--)).)....))))))....(((...(((((.((....).....................).)))))...)))........((((..(((-.(....(((.....((((((((((((((..((((....)))).....)))))))).)))))))))...).....)))....))))....(((((..(........))))))...
CBCs: ___________(__(__________________________)__)____________(_______________________________________)______________________________________________(____(___________________)____)_____________________________________________________________
HCBCs: __________________________________________________________(_____________________________________)_______________________(________________((_(______________________________________)_))_____________)________________(________________)_____ |
| Transferred percentage of helices |
I: 75
II: 90.909
III: 90.625
IV: 100
|
| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Viridiplantae
Chlorophyta
Chlorophyceae
Chlamydomonadales
Phacotaceae
Pteromonas
Pteromonas protracta
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 420
End: 652
|
