GI |
20624  |
Accession |
X64764 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Malpighiales ; Salicaceae ; Saliceae ; Populus ; Populus deltoides
|
Sequence |
ACGCATCGTCGCCCCCCGCTCCCCTCGGCTCACGAGGGCGGGGGCGGATACTGGTCTCCCGCGCGCTCCCGCTCGCGGCTGGCCCAAAATCGAGTCCTCGGCGACGGTCGCCACGACGAGCGGTGGTTGAGAGACCCTCGGACACTGTCGTGCGGGCCGTCGCCCCGGGATCTTCTGGACCCTCGGCATCGACCTTCTAGGATGCCTCGTTGCGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-84.8 kcal/mol |
Model |
105969559 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTCG-CCACCGATCCCCTCGGCTCACGAGGGTGGGGGCGGATGCTGGCCTCCCGTGCGCTCCCGCTCGCGGTTGGCCCAAAATCGAGTCCCGGGCGACGGTCGCCACGACGAGCGGTGGTTGAGAGACCCTTGAGAGCGGTCGTGCGCGCCCCCCGTCGCCCATAGGGACCTCGAAGGACCCTCGAGCATCGGCTTTTCTAGGATGCTCTCGTTGC-- ..(((((..((-((.(((...((((((.....))))))))).))))))))).((((..(((((.((....)).)))))..)))).....((((((((((((((((((.(((((((((..((...((((....)))).......)).)))))).)))....)))))))))...)))).))))).........(((((((...........))))))).......-- Query: ACGCATCGTCGCCCCCCGCTCCCCTCGGCTCACGAGGGCGGGGGCGGATACTGGTCTCCCGCGCGCTCCCGCTCGCGGCTGGCCCAAAATCGAGTCCTCGGCGACGGTCGCCACGACGAGCGGTGGTTGAGAGACCCTCGGACACTGTCGTGCGGG----CCGTCGCCC--CGGGATCTT-CTGGACCCTCG-GCATCGAC-CTTCTAGGATGC-CTCGTTGCGA ..(.(((..((.((.(((...((((((.....))))))))).))))))).).((((..(((((.((....)).)))))..)))).......(((((((.((((((((.(.(((((((..(....((((....))))........).)))))).).)----)))))))).--.)))).)))-..........(-(((((...-.......)))))-)......... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________(____________________)_______________(______(____________)______)_________(_____(__________________________________________________________________________)______)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.444 II: 100 III: 84.848 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 443
End: 657 |