| GI |
208659554  |
| Accession |
FJ216424 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCT |
| Structure |
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...)..))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(..(.(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))))))).))..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))........... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-39.1 kcal/mol |
| Model |
5764500 |
| Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA--------
----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...--------
Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGC-GGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCT
........(((((((((((((((.....-)))))))))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))...........
CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ______________(____((_(______)_))____)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 93.75
II: 92.308
III: 95.833
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 694
End: 895
|
