GI |
215401012  |
Accession |
FJ478078 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella acutata
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Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTTTTTCAGGTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-48.5 kcal/mol |
Model |
150035450 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTAAACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGATTCTAGCCGTAAAACCCCC-AATTTTTTAAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((......))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(-(((((....)))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCC-GACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTTTTTCAGGTT-- ....(((...((((((...))))))..)))(((((.((((...-..))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))..))).))))....)))....(((((....)))))-- CBCs: ____________________________________(____________)___________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________________________(_______________________________________)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 83.333 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 350
End: 511 |