GI |
215433643  |
Accession |
EU862227 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina cristata
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTGCAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTGACCTCGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-5.1 kcal/mol |
Model |
474144 |
Alignment |
Sbjct: ------AATCTTCAACTT--ACAGA-CCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTTNGAGGCTTGTCG-GCCATGTTTTGGT-CGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCGGTGTGATAAT-GTCTA--CGNCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTTGTGAGACAGCTTTA------------------------------------------- ------....((((((((--(((((-(((....))))))))))).))))).(((.((((...((((-((((.....))))-)))).))))..)))......((((((......(((..-..(((.(---(.((.((((((...-))).)--)).)).)))))....)))......)))))).......(((((......))))).......------------------------------------------- Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTGCAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTGACCTCGA ..........(((((((...(.(((.(........)))).).)).))))).(.(.((.(...((((.(((.......))).)))).).))..).)......(((((.......((......((..(...(.((.((((((....))).)..)).)).)).)).....)).......))))).......((.((......)).)).................................................. CBCs: ____________(_(_______(_______________)______)_)________(_(___________________________)_)________________(_______________(__________(_____________________)______)______________)____________(__(______)__)___________________________________________________ HCBCs: __________((____(______(__(________)_)____)_____))_____________(____(_________)____)______________________________(__________(________(_(___________)___)_____)________)____________________(______________)__________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 75 II: 80 III: 86.364 IV: 80 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 384
End: 637 |