GI |
154002627  |
Accession |
EF505596 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured endophytic fungus
|
Sequence |
ATGAAACCCTCTCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAATTTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-24 kcal/mol |
Model |
154002713 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAACCCTCTCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAATTTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAACACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAGA ...........((((((((...(((((....)))))...)))))))).....(((((..(((((((...))))))).)))))....(((.((((((.(((((((...(((((((((.((.((((((((...........((((.......(((((((((......))))))))).....))))...))))))))...)).))))))))).)))).)))))))..)).))).....(((((...))))). Query: ATGAAACCCTCTCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAATTTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAGA ...........((((((((...(((((....)))))...)))))))).....(((((..(((((((...))))))).)))))....(((.((((((.(((((((...(((((((((.((.((((((((...........((((.......(((((((((......))))))))).....))))...))))))))...)).))))))))).)))).)))))))..)).))).....(((((...))))). CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________(______________________________________)____________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured endophytic fungus

|
| Dikarya

Basidiomycota

Pucciniomycotina

Pucciniomycetes

Pucciniales

Pucciniaceae

Puccinia

Puccinia sorghi

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 420
End: 668 |