GI |
218454103  |
Accession |
FJ478127 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma ramosissimum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTATAAGCCTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAATCGTCTTGTATGGAGACAACGTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-55 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTATAAGCCTT---TGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAATCGTCTTG-TATGGAGACAAC-GTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.-((.(((((((((...))).)))))))).)))....)))---...)))))))).......(((((.-....)))))...-.............. CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(___(__(_(_(____)_)_)__)___)______________________________________________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 410
End: 611 |