GI |
219813340  |
Accession |
FJ553554 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
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Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGACTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACACCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-62.8 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGG---CGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(-((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....))---)))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGA---CTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACACCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(.(((((---....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))...))).)))))))))))..(((((....(((.((....))....))).....)))))........ CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________)___________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))_____________________________________________(_______(_________________)____)__________________________________(______(_____________)_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 94.118 IV: 90.909 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetidae

Boletales

Melanogastraceae

environmental samples

uncultured Melanogaster

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 722
End: 968 |