GI |
219813601  |
Accession |
FJ553815 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGACTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTTTACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCATCTTCCTCATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-59.8 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGG---CGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(-((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....))---)))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGA---CTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTTTACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCATCTTCCTCATTGACGTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(.(((((---....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))..(((((....((.(((....))...).)).....)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________(___(__________________________________________________)___)_______________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))_____________________________(_______________(_______(_________________)____)_____________)____________________(____________________________)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 97.059 IV: 90.909 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 722
End: 968 |