GI |
220966581  |
Accession |
FJ501554 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum/Ganoderma lucidum fusant
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
....((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))................. |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-55.9 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTAT----AAGACAGC-TTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((...))).)))))).)))))....)))---...)))))))).......(((((..----)))))...-.............. CBCs: ___________________________________________________________________(____)______________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_____________________________________________________________________(_________(_________________________)________)_________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 92.593 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured fungus

|
| Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Polyporales

Ganodermataceae

Ganoderma

Ganoderma lucidum

| Ganoderma sp. OE-236

|
|
|
| Cantharellales

Tulasnellaceae

mitosporic Tulasnella

Epulorhiza

Epulorhiza sp. AUG 002

|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 386
End: 584 |