GI |
6650331  |
Accession |
AF090855 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella cingulata ; Colletotrichum gloeosporioides
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG |
Structure |
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).)..... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-46.6 kcal/mol |
Model |
223016911 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAA-CCCCCAATTTTACTAAGGT ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))((((((-.......))))))...... Query: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG- ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).).....- CBCs: _______________________________________(_____)_____________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________(________________________________________)__________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 83.333 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 323
End: 484 |