| GI |
225007808  |
| Accession |
FJ196908 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulinaceae
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| Sequence |
GCGAAATTCTCAAGCGGTGGATGCTTTTTGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGGGAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCATTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGTTTATGGGTTGCTAATAACAATCTGTTCCATTTTTCAACTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-23.8 kcal/mol |
| Model |
310813988 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAACTCTCAAGCAAGAATTAAGCTTTATTGCTTGATTCTTGATTGGATTTGGACTCTTGCCGCGTTATT-------GCGGCTGGTCTTAAAAGTATTAGCTGGTCTGTAAGAAATCTTTGGGTTTGACTTGGCGTAATAAT--CTTATTCGCTGANGACACTTC----GGTGGCCTAATTTCTTTACTGGACTGCT-TCTAATCGTCTCCTTTGTGAGACAACTTTCATTCAATCT---------------
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Query: GCGAAATTCTCAAGCGGTGGATGCTTTTTGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGGGAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGATGGCATT-GGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCATT--TGGGTTGCTCTCTAATC-TGGTTTATGGGTTGCTAATAACAATCTGTTCCATTTTTCAACTTGA
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HCBCs: ___________________(__(____________)__)________________(_(___________________________)_)__________________(_(__(____(_______________((______(________)_____))________________________)____)____)_)______________(__(______)__)________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 87.5
II: 80
III: 83.333
IV: 80
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| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetes incertae sedis
Cantharellales
Cantharellaceae
environmental samples
uncultured Cantharellaceae
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| environmental samples
uncultured Cantharellales
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 380
End: 629
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