| GI |
225355317  |
| Accession |
FJ197212 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
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| Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGANAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGACTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTNCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-63 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGG---CGTCTTCCTTATTGACTTTTGA
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CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________)___________________________________________________________________
HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))_____________________________________________(_______(_________________)____)__________________________________(______(_____________)_______)____________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 94.444
III: 91.176
IV: 100
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| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetidae
Boletales
Suillineae
Suillaceae
Suillus
Suillus granulatus
| Suillus placidus
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| environmental samples
uncultured Suillaceae
| uncultured Suillus
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 357
End: 603
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