| GI |
2602  |
| Accession |
Z18976 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; mitosporic Glomerellaceae ; Colletotrichum ; Colletotrichum musae
|
| Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGGTTGA |
| Structure |
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.((((((((((((((.(((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(.(((((.....)))))). |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-48.7 kcal/mol |
| Model |
157697385 |
| Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCACTGCTTGGCGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTTTGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCC-AATTTTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..(((((((((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(-((((((...))))))).
Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..(((((((((((((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(.(((((.....)))))).
CBCs: ____________________________________(___________)_____________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 90
II: 100
III: 100
IV: 85.714
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 20
End: 184
|
