GI |
226346582  |
Accession |
FJ810128 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Favolus ; Favolus squamosus
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Sequence |
ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTTGTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTAATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTCCTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCATTTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCAATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-19.8 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATC-TACAAACTTCTTATGGGGTTTG--TAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGAT-AATGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTAC--AGAGACAACTTTT-----ATGACCTCTGA ....((..(((((((-((((((((((....))))))))--)))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((-...))).))))))))))))-....))).....))))))))).......(((((.....--.))))).......-----........... Query: ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTT----GTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTAATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTC-CTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCAT-TTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCAATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACATCTGA ....((...((((((..((((((.(..----).)))))..).)).))))..))(((((...(((((..((......))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(.-.(((((((((....))).))))))..)))).....))).-...))))))))).......(((((........)))))....................... CBCs: ________________________________________________________________(___((______))_)_________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(_____________________________)__________________((_(____________)_))_____________________(_______(______((__(___(_____(________)______)__)_))_______)_________)____________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 78.947 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 406
End: 624 |