GI |
1225976  |
Accession |
X74926 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion annosum species complex ; Heterobasidion annosum
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-38.9 kcal/mol |
Model |
182676346 |
Alignment |
Sbjct: ---ACACCCTCAACCTTCTCGGTTTCTTG---ACCGGGAAAGGCTTGGACTTTGGAGGTTTTCCTTTTTGCTGGCCTTCCCTTTGAAGCCAGCTCCTCCTAAATGAATTAGTGGGGTCC--GCTTTGCCGATCCTTGACGTGATAAGTATGCTTCTACGTCTTGG-GTTTTGCACCATTGGCCTGGAACCCGCTTCCAACAGTCTTCTTCGAAATGAAAAAGACAATGTCCGAC ---......(((((((((((((((....)---)))))).)))).)))).....(((((...........((((((.(((.....))))))))).)))))..........((((((.(((--(((.(((.(((((..((((((..(((....))).))))))..))-)))..))).....)))..))).)))))).......(((((.(((.....))).))))).......... Query: GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGAC-TTGGAGG-------CTTTGCTGGTCCTCGC----GGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCG-CCCCCGGTGTGATAATTG----TCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA---- .........(((((((.(((((((....)...))))))..))).))))..-..(((((-------....((((((.((...----)))))))).)))))..........((((.(.(((..(((..((.(-(((..((((((..(....----).))))))..)).).)..))......)))..))).).))))........((((.(((.....))).)))).......---- CBCs: _______________(_(_(((___________)))_)__)_________________________________(_(_________))____________________________(______(_____________(_____________________)___________________)______)_________________((_(((_____)))_))_____________ HCBCs: _____________________________________________________(_________________(_(___(_______)__)_)_______)____________((________((________(______(___________________)_______)_____________))________))__________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.333 II: 92.857 III: 82.759 IV: 87.5 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 365
End: 577 |