GI |
5734080  |
Accession |
AF141636 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Trichaptum ; Trichaptum abietinum
|
Sequence |
ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTACTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAGCATAACCTTTGACTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-56.5 kcal/mol |
Model |
21629936 |
Alignment |
Sbjct: ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTTAATCAGACCG-TGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGTATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTGCTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAACATAACCTTTGACTCTGACC .........(((((((((.(((((((.....)))))))-)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).))))).((..((...(((..(((((((.((((((.((((((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))).....))))))))))....))..)).(((((((((.......))))..))))).. Query: ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTACTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAGCATAACCTTTGACTCTGA-- .........(((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).))))).((..(....(((..(((((((.((((((.((((((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))).....)))))))))).....)..)).(((((((((.......))))..)))))-- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________)________________________________________(_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.143 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 81
End: 292 |