GI |
226442241  |
Accession |
FJ845400 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Albatrellaceae ; Albatrellus ; Albatrellus ovinus
|
Sequence |
ATGGAATTCTCAACTCTTCTGTCTTTGTTGATGGAAGGGCTTGGATTTTGGAGGTGTTTGCTGGCCTGGTGGGTCGGCTCCTCTTGAAAATATTAGCTTGAACCTTTGTGGATCAGCTGTTCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTCACTGTGAAGCCTTTAGTGCGGGGATCAGCTTCCAATCGTCTTGTTTGTGAGACAATTTACTTTGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-17.1 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGA-CTTGGAG--GCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCT-CTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTG-GCG------AGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG---GACAGCTTTA------------ ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))-...((((--(...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.(-(.(((((((((..-.))).)))))).))))).)))).)))..)-)).------(((((((((.((....)).)))---)).))))...------------ Query: ATGGAATTCTCAACTCTTCTGTCTTTGTTGATGGAAGGGCTTGGATTTTGGAGGTGTTTGCTGGCCTGGTG--GGTCGGCTCCTCTTGAAAATATTAGCTTGAACCTTTGTGGATCAGCTGTTCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTCACTGTGAAGCCTTTAGTGCGGGGATCAGCTTCCAATCGT-CTTGTTTGTGAGACAATTTACTTTGACCTCTGA .........((((((((((((((......)))))))))).)))).....((((..(...(((((((.....--))))))).)))))...........(((.((...(((.(....(((.(...(((((((((....))).))))))..)))).))))..))..).)).......((.((((((.((.-..)).)))...)).).))............... CBCs: _______________(((((_(________)_)))))_______________________________________________________________________________(_________________________________)______________________________________________________________________ HCBCs: ____________________(__________)____________________________((_______________))___________________________(___(__________________________________________)__)__________________(____(____(____)____)________)________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 92.308 III: 91.667 IV: 90.909 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 452
End: 669 |