| GI |
116876118  |
| Accession |
EF025112 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGGCTTTGTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTACAGATTCTTCAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
..........(((((((.(((((.(((...)))))))).....))).)))).((.(..((.(...(((((.(((.......)))))))).).))).)).......(.(......(((.(.(..(.((.((....((((((((((....))).)..)))))))).)))).).)))).)............((((((.....))))))............................................. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-6.3 kcal/mol |
| Model |
223551593 |
| Alignment |
Sbjct: ----GAATTCTCAACCCATAGAT---CCTTGTGGTCTA----CGGGCTTGGATTTG--GAGGCTTGCCG-GCCCTTACACGGGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGA-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA--CGCTGTGGCCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCGTTAGGACAACTTCTTGACAT------------------------------------------
----......(((((((.(((((---(.....))))))----.))).)))).((.(--((((...((((-(((((.....))))))))).))))).)).......((((((...(((.(((.-..(((((---..(((((((((....))).)--))))).))))).....))).)))))))))...........(((((((.....)))))))..------------------------------------------
Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGGCTTTGTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACAT----CTTTTGG---GATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTACAGATTCTTCAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.(((((..........))))).....))).)))).((.(..((.(...((((..(((.......))).)))).).))).)).......(.(......(((.(.(....((.((.....(((((((((....))).)..))))).)).)).----).).)))---).)............((((((.....)))))).............................................
CBCs: ______________(_(__________________________)_)_____________(_(____________________________)_)________________________________(_______________________________________)________________________________(___________)_______________________________________________
HCBCs: __________________((________________))_______________(_________________(___________)____________)_________________(_____________(_________(_(___________)___)_____)______________)___________________(___(_____)___)______________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 92.308
II: 81.25
III: 76.923
IV: 85.714
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 372
End: 622
|
