| GI |
2289047  |
| Accession |
U66440 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Multiclavula ; Multiclavula corynoides
|
| Sequence |
GTGAAGCTCTCAAGCTGGTCGCTTTATTGTCGATTGCAGGCTTGGACGTGGACTCTGACGTTTTCGCAAGAGAANGACTGGTCTAAAATACATTAGCTGACCCTTGTTGTGGATTCGGTTCTACTCGACGTGATAAATATCTATCGTCGAGGACATCCCCAGGGATGGCCGGACTCGCCTCGGGACGCTTCTAATCGTGTTCTTGGACACAACTTTNTCAAATTTGA |
| Structure |
.........((((((((..((.((.(...).)).))))).)))))....(((((..(.(((((((....))))))).).)))))..........(((.(...((((..(((..(((((((...(((((((((((....))).).)))))))))....))..))).))...........).)))).)))).......(((((...)).)))................. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-12.2 kcal/mol |
| Model |
166361535 |
| Alignment |
Sbjct: ATGGAATTCTCAACCTA--TAAATCTTTGTGGTTTATGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCCGGCCTC---AATGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCG-TGCGGA-TCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA-CGCTGTGAA----CCGTGAAGTG-----------TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCCTTTGGG-ACAATTTATTGACA-----
.........((((((((--((((((.....)))))))))).))))....(((((...(((((((..---...))))))).)))))..........((((((...(((-.(((..-.(((.(---(.(((((((((....))).)-))))).)).----))).....))-----------).))))))))).......(((((...)))-))............-----
Query: GTGAAGCTCTCAAGCTGGTCGCTTTATTGTCGATTGCAGGCTTGGACGTGGACTC-TGACGTTTTCGCAAGAGAANGACTGGTCTAAAATACATTAGCTGACCCTTGTTGTGGATTCGGTTCTACTCGACGTGATAAATATCTATCGTCGAGGACATCCCCAGGGATGGCCGGACTCGCCTCGGGACGCTTCTAATCGTGTTCTTGGACACAACTTTNTCAAATTTGA
.........((((.(((..((.((.......)).)))))..))))....(((((.-.(.(.(((........))).).).)))))..........(((......(((..(((.....((.(...(.(((((((((....))).).))))).)).....))......))...........).)))...))).......((.((...))..)).................
CBCs: ________________(__(__(_________)__))_______________((_______((__________))_____))_____________________________________________((__________________))_______________________________________________________________________________
HCBCs: _______________(____(_____________)__)_________________________(________)_______________________________(((__((_________(________(____(____)______)_____)______________)___________)_)))________________((___))_____________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 78.571
II: 83.333
III: 84.615
IV: 80
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 405
End: 631
|
