GI |
2289048  |
Accession |
U66439 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Multiclavula ; Multiclavula vernalis
|
Sequence |
GTGAAGCTCTCAAGCTGGTTGCTTTATTGTCGACTGTAGGCTTGGATATGGATTTTGGCGCTTTCATCAGAGAGCGACTAGTCCTAAATGCATTAGCTGACCCTTGTTTTGTGGATTCGGTTCTACTCAACGTGATAAGTATCAATCGNTGAGGACATCTCCAGGGATGGCCGGATGCGCCTTGGGACGCTTCTAATCGTGTTTTCGGACACATTTTNTCAACTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-22.01 kcal/mol |
Model |
325514407 |
Alignment |
Sbjct: ATTTAATTCTCAACCTTATTAGCTT-TTGCTGATAAT-GGCTTGGATGTGGGGGTTTTCTTTTGCTGGCTTTCGTCAGCTCC---CCTTAAATGCATTAGCTGGTGCC--CCGCGTGGACT---GTCCGTTCGGTGTGATAATTATCTA-CGCCGTGGATGTCTGCA----------AATAGGTTTTGCACTGCTTCTAACYGTCTGTTCATTTGGACAATACATGACAA-TTTGA .........((((((((((((((..-..)))))))).-)).))))....(((((.........((((((....)))))).))---))).....((.((((.((((((.--((..((((((.---((((...(((((((((....))).)-))))).)))))))))).----------....))....))))))...))))..)).(((((....)))))...........-..... Query: GTGAAGCTCTCAAGCTGGTTGCTTTATTGTCGACTGTAGGCTTGGATATGGA----TTTTGGCGCTTTCATCAGAGAGCGACTAGTCCTAAATGCATTAGCTGACCCTTGTTTTGTGGATTCGGTTCTACTCAACGTGATAAGTATCAATCGNTGAGGACATCTCCAGGGATGGCCGGATGCGCCTTGGGACGCTTCTAATCGTGTTTTC----GGACACATTTTNTCAACTTTGA .........((((.(((((((.(.....).))))))..)..))))....(((----.......((((((....))))))......))).....((.((((.((.(((...(...(.((((.....(((...((.((((((....))).).)).)).))).)))).)................)....))).))...))))..)).(.(((----))).)................. CBCs: ________________((__(_________)__))________________(______________((______))_________)__________________((_____________(____________(____________________)______)___________________________))______________________________________________ HCBCs: _______________(______(_____)______)_____________(_____________________________________)______________(_______(________________(______(________________)____)_________________________)________)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 81.818 III: 84.848 IV: 80 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 419
End: 646 |