GI |
157072729  |
Accession |
EF622197 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella acutata
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA |
Structure |
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.((((((((((((((.(((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..).)))))))...)))...(((((..(...)))))). |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-47.6 kcal/mol |
Model |
148807690 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCA-AGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.....-.))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.......))))). CBCs: ____________________________________(___________)_____________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 325
End: 489 |